Dトレーダー
敵を撃墜した際などに入手できる"Zチップ"を使って、強化パーツ等の売買を行うシステム。 "Dトレーダー"は各シナリオクリア後のインターミッション画面で利用可能。
強化パーツ
Dトレーダーだけで買える特殊な強化パーツ。非常に強力なものが揃っている。 販売される強化パーツは最初は購入不可・封印されているが、 それぞれに設定されている開放条件をゲーム中でクリアすることで購入可能となる。 それぞれ最大1つまでしか購入することができない。
強化システム
購入すると部隊全体に特別な効果を及ぼすシステム。 強化パーツ同様に開放条件をクリアすることで購入可能。全4種。
エクストラ
シナリオ毎に設定された、そのインターミッション中でのみ購入可能なアイテム。
基本的には3話周期でブースターやマグネットコーティングなどの普通のパーツが売り出され続ける。 一部の商品は特定の条件を満たしていないと購入することができない。
サブオーダー
前話に参加しなかったパイロットが特殊なボーナスを獲得できるシステム。 各サブオーダーはそれぞれ6人ずつ、計24人が参加可能。(前作は5*4の20人)
トレーニング : PP20獲得
パトロール : 撃墜数2獲得
シミュレーター : 経験値500獲得
資金調達 : 参加したパイロットのレベルの合計*300の資金獲得