難易度は「カジュアル・ノーマル・ハード」の3つ。
難易度を変えることによって出現する敵のHPやステータスが変わる。 ノーマルを基準として、カジュアルにすると下がり、ハードにすると上がる。 ゲーム中にいつでもコンフィグから難易度は変えられる。
基本的には遊び応えの問題であって、メリット・デメリットは存在しない。
"ブレイブリーセカンドプレイヤーズサイト"と連動させている場合、 特定の難易度でゲームをクリアすると該当するアチーブメントを獲得できる。
ノーマル以上固定
ゲーム開始時からノーマルまたはハードを選び、本編クリアまで、難易度「ノーマル」以上で通すと該当するアチーブメント獲得
ハードモード固定・殿堂入り
ゲーム開始時からハードを選び、その後一度も難易度を変えずに本編をクリアすると、 "殿堂入りプレイヤー"としてサイトに登録され、なおかつ該当するアチーブメント獲得。
ハード固定クリアでもらえるアチーブメント「時空のベゼル」はゲーム内最強の盾。 隠しボスを倒すことでも1つ入手することができる。
ちなみに前作の殿堂入り条件から大幅に簡単になり、ハードでクリアするだけで達成できるようになっている