全メイン・サイドミッション一覧、加入タイムテーブル

主人公別：クロス

★1-1A 花と忍と誕生日

• ・エーアデント / エチカ
  ・ルーンドラッヘ / クロス
  ・レンレン（アシストクルー）
  ・アイティ（アシストクルー）
  ・クッキン（アシストクルー）

主人公別：フォルテ

★1-1B 花咲く園に花来たる

• ・エーアデント / エチカ
  ・ルーンドラッヘⅡ / フォルテ
  ・レンレン（アシストクルー）
  ・アイティ（アシストクルー）
  ・クッキン（アシストクルー）

攻略パターンA

★1-2A 目覚める天の鬼

• ・ゲッターアーク / 拓馬

★1-3A 合体竜人

• ・ダイナゼノン / ガウマ
  ・ちせ（アシストクルー）

攻略パターンB

★1-2B 怪獣使いと竜

• ・ダイナゼノン / ガウマ
  ・ちせ（アシストクルー）

★1-3B 運命の子ら

• ・ゲッターアーク / 拓馬

★1-4 開かれる扉

• ・ゴッドガンダム / ドモン
  ・ライジングガンダム / レイン
  ・ルーンドラッヘ 特殊能力 / エナジー・リンク
  ・エーアデント 特殊能力 / システム・ニーラカナイ
  ・エーアデント 特殊能力 / 補給装置装備
  ・エーアデント サブパイロット / ノーヴィー,ミナ

★ 託された勇者たち

• ・ライディーン / 洸
  ・グレートマジンガー / 鉄也
  ・マリ（アシスト）

★ 漂流する異邦人

• ・ダンバイン / ショウ
  ・エルガイム / ダバ
  ・キャオ（アシスト）

★ 魔女と花嫁と天使

• ・ウイングガンダムゼロ / ヒイロ
  ・ガンダムデスサイズヘル / デュオ
  ・ヒルデ（アシスト）

★ 呪いのモビルスーツ

• ・ガンダムエアリアル / スレッタ
  ・デミトレーナー チュチュ専用機 / チュチュ
  ・ミオリネ（アシスト）
  ・ニカ（アシスト）

★ 深淵からの帰還者

• チャート上は「銀河から来た歌姫」と2分岐だが順番にミッションを選ぶことになる
• ・ランスロット・アルビオンゼロ / スザク
  ・ミリアリア（アシスト）

★ 銀河から来た歌姫

• ・VF-31J ジークフリード / ハヤテ
  ・VF-31F ジークフリード / メッサー
  ・VF-31C ジークフリード / ミラージュ
  ・VF-31E ジークフリード / チャック
  ・VF-31S ジークフリード / アラド
  ・マクロス・エリシオン / アーネスト
  ・フレイア（アシスト）
  ・美雲（アシスト）
  ・カナメ（アシスト）
  ・マキナ（アシスト）
  ・レイナ（アシスト）

DLC：異界から来るもの

• 「主人公は男性」「主人公は女性」の選択肢。
  ソウジとチトセは両方加入。ヴァングネクスとグランヴァングで自由に乗せ替え可能となっており、直接的な変化は無し。
• 加入
  ・ソウジ / ヴァングネクス
  ・チトセ / グランヴァング
  ・サブパイロットのナインは共通
  ・サイバスター / マサキ

DLC：揺れる次元

• 1回目の選択肢
  イオリ(男性)とアマリ(女性)どちらがメインパイロットになるか。
  選んだ方がメインパイロット、選ばなかった方がサブパイロット
• 2回目の選択肢
  サイゾウ(男性)かサギリ(女性)のどちらが後継機のパイロットになるか。
  選んだ方がティラネード・レックス、選ばなかった方がティラネードのパイロット
• ・ゼルガード / イオリorアマリ
  ・サブパイロットのホープスは共通
  ・ティラネード・レックス / サイゾウorサギリ
  ・ティラネード / サギリorサイゾウ
  ・サブパイロットのラミィはレックス側

激突！新たなガンダムファイト！

• ・ガンダムマックスター / チボデー
  ・ガンダムローズ / ジョルジュ

すぐそこにある悪意

• ・紅蓮特式 / カレン
  ・ノーベルガンダム / アレンビー

怒れる鐘の向こうに

• ・フォースインパルスガンダム / シン

キャンベル星人の謎

• ・コン・バトラーV / 豹馬
  ・ロペット（アシスト）

戦うことの意味

• ・なし

ロンデニオンの鐘

• ・リ・ガズィ（BWS） / アムロ
  ・ガンダムMk-Ⅱ / エマ
  ・メタス / ファ
  ・ラー・カイラム / ブライト
  ・アストナージ（アシスト）

赤い彗星の眼差し

• ・

シャアとアムロと

• ・フルアーマー百式改 / カミーユ
  ・ヤクト・ドーガ / ギュネイ
  ・ヤクト・ドーガ / クェス
  ・量産型νガンダム

マジェスティックプリンス出撃

• ・レッドファイブ / イズル
  ・ブルーワン / アサギ
  ・パープルツー / ケイ
  ・ローズスリー / タマキ
  ・ゴールドフォー / スルガ

ヒーローへの道

6人目のユウウツ

• ・ゴディニオン / スズカゼ
  ・ライノス / ランディ
  ・ブラックシックス / アンジュ
  ・レイカ（アシスト）

紅い渦

• ・ジェットジャガー

聖少女たち

• 解放条件
  ・ダバとショウの合計撃墜数50以上
• ・ビルバイン / ショウ
  ・ダンバイン / マーベル（ショウ機の引継ぎ）
  ・ヌーベル・ディザード / レッシィ
  ・グラン・ガラン / シーラ
  ・ニー＆キーン（アシスト）

悠久のバイストン・ウェル

• ・サーバイン / シオン

刻をこえて、宇宙をこえて

• 解放条件
  ・「シャアとアムロと」クリア後
  ・アムロとカミーユの合計撃墜数90以上
• ・νガンダム / アムロ
  ・Zガンダム / カミーユ
  ・チェーン（アシスト）

正義と友情、その行方

• ・ガンダムサンドロック改 / カトル

運命を決めるもの

• 解放条件
  ・シンの撃墜数50以上
• ・デスティニーガンダム / シン
  ・フォースインパルスガンダム / ルナマリア

痛みを知る者たち

• 解放条件
  ・ヒイロの撃墜数55以上
• ・

ダブル・ハート

• 解放条件
  ・ダバの撃墜数55以上
• ・

鳥は滅びを歌う

• 解放条件
  ・豹馬と洸の合計撃墜数100機以上
• ・